SARS-CoV-2 ištakos: dar nenustatoma

SARS-CoV-2 ištakos: dar nenustatoma

Oro pajėgų vyresnioji pilotė Jada Williams ir oro pajėgų 1-os klasės pilotė Daniella De Mier Eusse, medicinos technikai, paskirti į Oro pajėgų karinę medicinos komandą, dislokuotą į Lawrence, Mass., Dalyvaukite pomirtinės priežiūros mokymuose, kuriuos vedė Judy Michaud, Lawrence profesinio tobulėjimo specialistė. Bendroji ligoninė, kaip dalis reagavimo į COVID-19 operacijų Lawrence, Mass., vasario mėn. 11, 2022. Nuotrauka: Army Spc. Danielis Thompsonas.

SARS 2003 m. ir MERS 2012 m. atsirado dėl natūralaus išsiliejimo įvykių, per kuriuos gyvūnai užkrėtė žmones koronavirusu. Abiem atvejais buvo gauta dviejų įtikinamų įrodymų: (1) virusai ir (arba) antikūnai prieš virusus buvo nustatyti ir žmonėms, ir gyvūnams, ir (2) žmonėms, kurių profesinis poveikis gyvūnams buvo nustatytas didesnis seropozityvumas virusų nei bendra žmonių populiacija. Kol kas tyrimai, patvirtinantys natūralų COVID-19 plitimą, įskaitant kai kuriuos neseniai spaudoje pabrėžtus, šių kriterijų neatitinka.

SARS. SARS (sunkaus ūminio kvėpavimo sindromo) atveju buvo aiškūs įrodymai, kad virusas kilo iš gyvūnų. Viename tyrime buvo atrinkti gyvūnai, parduodami gyvų gyvūnų turguje Guangdonge, Kinijoje, ir palmių civetose aptikti virusai, kurių genomo sekos 99,8 procento identiškos žmogaus SARS virusui. Šie virusai buvo glaudžiai susiję su SARS-CoV. Kitas tyrimas parodė, kad 80 procentų palmių civetų iš Guangdžou gyvūnų rinkos buvo teigiami SARS-CoV antikūnai. Pirmieji SARS pacientai skerdė arba virė laukinius gyvūnus, todėl profesinėje aplinkoje buvo užsikrėtę SARS-CoV.

Guangdongo provincijoje atliktas epidemiologinis tyrimas beveik 800 žmonių ištyrė imunoglobulino G (IgG) antikūnus prieš SARS-CoV. Asmenys, kurie prekiavo daugiausia kaukėmis delninėmis civetėmis, turėjo didžiausią pozityvumo rodiklį – beveik 73 proc. Kinijos SARS molekulinės epidemiologijos konsorciumas naudojo viso genomo sekos nustatymą ankstyviems SARS viruso atvejams ir molekulinei evoliucijai stebėti. Jie nustatė, kad pradinėje epidemijos fazėje vyravo du pagrindiniai virusų genotipai. Vienas genotipas buvo beveik identiškas mėginiams, paimtiems parduoti ir iš žmonių, dirbančių gyvų gyvūnų rinkoje Šendžene. Kitas genotipas buvo identiškas mėginiams, paimtiems iš ūkiuose auginamų civetų ir ankstyviausiais žmonių atvejais Zhongshan mieste. Išvada: įtikinami SARS-CoV gyvūninės kilmės įrašai.

MERS. Po MERS (Artimųjų Rytų kvėpavimo sindromo) atsiradimo žmonėms mokslininkai nustatė, kad dromedarų kupranugarių Vidurio Rytuose, Šiaurės ir Rytų Afrikoje bei kai kuriose Azijos dalyse buvo nustatyti MERS-CoV antikūnai. Suarchyvuotiems dešimtmečiais datuotiems dromedarų kupranugarių kraujo mėginiams buvo nustatyti MERS-CoV antikūnai, o tai rodo, kad kryžmiškai reaguojantys virusai kupranugariuose cirkuliavo dešimtmečius.

2012–2013 m. atliktas serologinis tyrimas, kuriame dalyvavo daugiau nei 10 000 sveikų suaugusių žmonių iš 13 Saudo Arabijos provincijų, MERS-CoV antikūnų aptiko 0,15 procento mėginių. Kupranugarių aviganių MERS-CoV antikūnų seropozityvumo rodikliai buvo atitinkamai 15 kartų didesni, o skerdyklų darbuotojų – 23 kartus didesni nei visos populiacijos. Išvada: įtikinami MERS-CoV gyvūninės kilmės įrodymai.

COVID-19. Priešingai nei SARS ir MERS, nėra tiesioginių natūralaus COVID-19 plitimo įrodymų. Nei virusas, nei antikūnai prieš virusą nebuvo identifikuoti gyvūnams, kurių mėginiai buvo paimti Uhane 2019 m. arba 2020 m. pradžioje. Straipsnyje, kuriame šiuo metu atliekama tarpusavio peržiūra, Gao ir kt. radau tai nulis iš 457 mėginių, paimtų iš 18 rūšių gyvūnų, paimtų Uhane 2020 m. pradžioje, buvo nustatytas SARS-CoV-2. Be to, nepastebėta jokios koreliacijos tarp žmonių profesinio poveikio gyvūnams ir didesnio užsikrėtimo ar seropozityvumo virusui.

Iki 2020 m. pradžios Kinijos gydytojai atliko daugybę tūkstančių žmonių serologinių tyrimų, siekdami įvertinti SARS-CoV-2 antikūnų paplitimą, tačiau nė viename nebuvo duomenų apie profesiją. Jei būtų įtrauktos profesijos, jos būtų galėjusios atskleisti, ar Huanano rinkoje dirbantys gyvūnai turėjo didesnį SARS-CoV-2 antikūnų rodiklį nei bendroje populiacijoje, o tai patvirtintų natūralaus išsiliejimo hipotezę.

Du naujausi dokumentai, Worobey ir kt. ir Pekar et al., pateikia geografinę gyvūnų gardų analizę Huanan rinkoje ir virusų filogenetinę analizę, tačiau nepateikia įtikinamų natūralaus išsiliejimo įrodymų. Worobey aptarti duomenys ir analizės yra vienodai atitinka abi hipotezes: (1) kad SARS-CoV-2 pirmą kartą pateko į žmones Huanano jūros gėrybių turguje Uhane, ir (2) kad SARS-CoV-2 pirmą kartą pateko į žmones kitoje vietoje ir buvo įtrauktas į rinką, o vėliau. stiprinama rinkoje žmonių. Autorių teiginys, kad duomenys ir analizės patvirtina tik natūralaus išsiliejimo hipotezę, yra klaidingas.

Gao ir kt. padarė išvadą, priešingą Worobey ir kt. ir Peckar ir kt. Gao ir kt. pranešė, kad Huanano turguje nebuvo teigiamų gyvūnų mėginių. Jie taip pat pranešė, kad nebuvo jokio ryšio tarp gyvūnų pardavėjų vietų rinkoje arba vietų, kuriose žmonių tankis didžiausias, ir teigiamų aplinkos mėginių vietų rinkoje. Remdamiesi šiomis išvadomis, Gao ir kt. teigė, kad rinka „veikė kaip stiprintuvas“, o infekcijas į rinką atnešė žmonės, užsikrėtę kitur.

Hipotezė, kad SARS-CoV-2 atsirado dėl su laboratorija susijusio išsiliejimo, pavyzdžiui, dėl laboratorijoje įgytos infekcijos, išlieka perspektyvi galimybė. Nelaimingi atsitikimai laboratorijoje, įskaitant laboratorijoje įgytas infekcijas, įvyksta dažnai. Paskutiniais metais, kurių turimi duomenys, CDC / USDA Select Agent Program gavo 205 pasirinkto agento vagystės / praradimo / išleidimo ataskaitas, o tai prilygsta vidutiniškai keturiems pasirinkto agento incidentams per savaitę. Iš 205 pasirinkto agento vagystės / praradimo / paleidimo ataskaitų visiškai 196 buvo pranešimai apie išleidimą, o 177 buvo „nustatyta, kad atspindi galimą profesinį poveikį laboratorijos darbuotojams“.

Norint nustatyti SARS-CoV-2 kilmę, reikia bent jau: (1) duomenų iš serologinių mėginių ėmimo 2019 m. ir 2020 m. pradžioje, įskaitant informaciją apie profesiją ir vietą ir apimančius Uhano gyvūnų rinkos darbuotojus ir Uhaną. laboratorinių tyrimų darbuotojai ir (2) informacija, įskaitant mėginius, sekas, įrašus ir rezultatus, apie su SARS susijusių koronavirusų tyrimus, kuriuos 2015–2019 m. atliko Uhano mokslininkai ir jų bendradarbiai.

Mokslas yra objektyvus tiesos siekimas. Norint išvengti būsimų COVID-19 pandemijų, reikia rasti tiesą. Ankstyvas, klaidingas „nepozityvių įrodymų“ ar „įrodymų“ pareiškimas nesukelia visuomenės pasitikėjimo mokslu ir neapsaugo visuomenės sveikatos.

Padėka: Kahnas norėtų padėkoti Elisai Harris, Miltonui Leitenbergui ir Richardui Ebrightui už neįkainojamus komentarus, pakeitimus ir pasiūlymus.

Parašykite komentarą

El. pašto adresas nebus skelbiamas.